>линия кончается в ЗАТО Северск

Нет, в Белом Яре, это ещё 300 км.
Электрификация линии на Томск не имеет никакого отношения к Северску, туда грузопоток почти нулевой.
Электрификация - скорее ради гигантского Томского НПЗ. Именно поэтому заканчивается чуть севернее Томска, на станции Копылово, где находится НПЗ.